Fungal evolution: diversity, taxonomy and phylogeny of the Fungi
Naranjo-Ortiz MA, Gabaldón T (2019)
Fungal evolution: diversity, taxonomy and phylogeny of the Fungi.
Biol Rev 94:2101–2137.
https://gyazo.com/a394a9aa452d9abe4191335c6149c229
Abstract and figures
The fungal kingdom comprises a hyperdiverse clade of heterotrophic eukaryotes characterized by the presence of a chitinous cell wall, the loss of phagotrophic capabilities and cell organizations that range from completely unicellular monopolar organisms to highly complex syncitial filaments that may form macroscopic structures. Fungi emerged as a ‘Third Kingdom’, embracing organisms that were outside the classical dichotomy of animals versus vegetals. The taxonomy of this group has a turbulent history that is only now starting to be settled with the advent of genomics and phylogenomics. We here review the current status of the phylogeny and taxonomy of fungi, providing an overview of the main defined groups. Based on current knowledge, nine phylum‐level clades can be defined: Opisthosporidia, Chytridiomycota, Neocallimastigomycota, Blastocladiomycota, Zoopagomycota, Mucoromycota, Glomeromycota, Basidiomycota and Ascomycota. For each group, we discuss their main traits and their diversity, focusing on the evolutionary relationships among the main fungal clades. We also explore the diversity and phylogeny of several groups of uncertain affinities and the main phylogenetic and taxonomical controversies and hypotheses in the field.
真菌界は、キチン質細胞壁の存在、食作用の喪失、単細胞の単極性生物からマクロな構造を形成しうる非常に複雑な合糸体までの幅広い細胞組織を特徴とする従属栄養真核生物の超多様なクレードから構成されています。真菌は、動物か植物かという古典的な二分法から外れた生物を包含する「第三の王国」として登場した。このグループの分類学は激動の歴史を歩んできたが、ゲノミクスと系統学の出現により、ようやく決着がつき始めたところである。ここでは、真菌類の系統と分類の現状を概観し、主に定義されたグループの概要を説明する。現在の知識に基づいて、9つの門レベルのクレードを定義することができる。オピストスポリジウム門、ツボカビ門、ネオカリマスチゴミセス門、ブラストクラジオミセス門、ゾーパゴミセス門、ムコールミセス門、グロメロミセス門、担子菌門、アスコミセス門である。各グループについて、その主な特徴や多様性について、主な菌類群間の進化的関係に焦点を当てて議論する。また、関連性が不明なグループの多様性と系統、およびこの分野における主な系統学的・分類学的論争と仮説についても探求する。